В новом календарном году 392 года в Нео-Токио молодой человек, Агино Цзиро, крадет систему синхронизации времени и пытается уйти в прошлое. Власти гоняются за его кораблем и наносят ему ущерб, заставляя его приземлиться в современном Токио, Определившись, он врывается в фургон и присоединяет устройство, безрассудно похищая Нобучо, Шиничи, Теко и их учителя, Хокубэй. Первоначально силы сопротивления высадили их в Токио 9 марта 1945 года во время американской бомбардировочной кампании. Опять уходя в прошлое, группа в конце концов приходит к периоду Враждующих государств. Там будущее и прошлое сталкиваются, поскольку фракции эпохи Цзиро пытаются изменить свое прошлое в решающий момент в Хоннойдзи.