Куроба Кайто - семнадцатилетний школьник, который благодаря влиянию своего отца, Куроба Тоичи, таинственно умер. Спустя восемь лет после смерти отца, Кайто обнаруживает в своем доме потайную комнату, которая была создана его отцом, чтобы раскрыть себя в тот самый день. Найдя в комнате гаджеты и костюм Малыша-Призрака, Кайто снимает маскировку и решает противостоять Малышу, который недавно появился на свет после своего восьмилетнего отсутствия. Кайто обнаруживает, что Малыш - это Чжии Коносукэ, дворецкий его отца, который выясняет, что Тоити был первым Малышом-Призрачным Вором. Джии выясняет, что он взял на себя роль Малыша, чтобы выманить убийцу Тоити. Узнав, что его отец был убит, Кайто продолжает играть роль Малыша Призрачного Воря в поисках убийцы своего отца.