Масару, студент второго курса средней школы, непобежденный в битве, встречает цифрового монстра Агумона, который сбежал из DATS, секретной правительственной организации. Несмотря на ужасные первые впечатления, они стали лучшими друзьями, разговаривая кулаками. Вместе с другими, Масару и Агумон работают над расследованием различных инцидентов, связанных с цифровым миром и цифровыми монстрами, чтобы попытаться разобраться в сути событий.