Аято Камина был разлучен со своей любимой девушкой Харукой Мишимой, когда произошла странная катастрофа, в которой как полагали жители Токио погиб весь мир за границами города. Но однажды, 3 года спустя на город нападают захватчики. Именно в это время Аято встречает агента ТЕРРЫ, Харуку Шито, которая обещает показать ему правду мира сего. Так начинаются странные события, в следствии которых он активирует Меху(огромного робота), Ра-Зефона, и обнаруживает, что многие люди живущие с ним рядом, в том числе его мать имеют синию кровь, и тот страшный факт, что Токио был изолирован от всего окружающего мира, в каком-то измерении, где время течет иначе...