FLCL: Альтернативные центры по злоключениям 17-летней Кана, старшеклассницы, которая проводит свои дни, тусуясь со своими лучшими друзьями, Моссан, Хиджири и Домашними животными. Они живут ничем не примечательной жизнью, пока в день, когда с неба не падает Меча, вместе со странной женщиной по имени Харуко.